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科學(xué)家的需求
科學(xué)家們每天都在處理大量分布在多臺儀器和多個實(shí)驗(yàn)室中的數(shù)據(jù)。傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)管理方式,如使用移動硬盤進(jìn)行數(shù)據(jù)復(fù)制,不僅繁瑣且效率低下,從歷史研究中檢索數(shù)據(jù)更具挑戰(zhàn)性。因此需要一種更簡便、智能的方式來與同事、合作者和客戶共享數(shù)據(jù)、方法和結(jié)果。同時,提高實(shí)驗(yàn)室生產(chǎn)力也始終是科研的首要問題,這需要更多的自動化、更快的處理速度以及更好的儀器利用率。充分利用歷史數(shù)據(jù),尋找預(yù)測模式,并從海量的研究中獲得更深入的洞察也是越來越迫切的要求。Thermo Scientific Ardia平臺正是基于滿足這些需求而開發(fā)的。
在開發(fā)Ardia平臺的過程中,我們關(guān)注了四個核心領(lǐng)域,并將這些理念貫穿到了軟件的設(shè)計與應(yīng)用之中:
協(xié)作:將人員、數(shù)據(jù)和儀器集中在一個平臺上,鼓勵數(shù)據(jù)和知識的共享。
生產(chǎn)力:通過自動化工作流程和加快處理速度,提高實(shí)驗(yàn)室生產(chǎn)力。
深度洞察:通過將數(shù)據(jù)集中管理、相互關(guān)聯(lián)并進(jìn)行標(biāo)識,有助于進(jìn)行深度挖掘以獲得更多的見解。
安全:通過用戶權(quán)限管理、審計追蹤、結(jié)果版本控制以及內(nèi)置的備份和歸檔功能,確保數(shù)據(jù)在一個安全的環(huán)境中得到管理。
連接應(yīng)用程序
Ardia平臺支持一系列集成的軟件包,包括Chromeleon、Biopharma Finder、Proteome Discoverer和Compound Discoverer。
Chromeleon色譜數(shù)據(jù)系統(tǒng)可以在合規(guī)的前提下支持包括高分辨質(zhì)譜在內(nèi)的系統(tǒng),通過與Ardia 結(jié)合進(jìn)一步提升了MS數(shù)據(jù)處理的性能。
BioPharma Finder支持多種工作流程,包括完整質(zhì)量分析、肽圖分析、寡核苷酸分析、自上而下分析,通過Ardia 平臺將來自Chromeleon和Xcalibur的數(shù)據(jù)集中到一個中心位置,促進(jìn)協(xié)作和效率,并輕松生成全面和可定制的報告。
Proteome Discoverer與CHIMERIS合作,支持各種采集方法。在Ardia 平臺的支持下,數(shù)據(jù)收集和搜索并行進(jìn)行,提升了處理速度,顯著節(jié)省了時間。
Compound Discoverer 主要用于小分子數(shù)據(jù)處理,提供了未知峰檢測、交互式數(shù)據(jù)可視化和高級化合物注釋工具,結(jié)合Ardia平臺處理后速度顯著提升。
賽默飛還致力于開放平臺,允許與非Thermo科學(xué)軟件應(yīng)用程序進(jìn)行有效連接。例如,Skyline通過Ardia API直接訪問數(shù)據(jù),不再需要手動下載或外部文件管理。對于其它第三方軟件,則可以通過Ardia Sync 進(jìn)行數(shù)據(jù)和結(jié)果的同步。
提升分析工作流的生產(chǎn)力
Ardia Core軟件相當(dāng)于Ardia的操作系統(tǒng),處理諸如用戶配置文件、數(shù)據(jù)管理、備份和歸檔等任務(wù),確??茖W(xué)家們可以在一個安全、受控的環(huán)境中進(jìn)行數(shù)據(jù)和結(jié)果的共享。
Ardia Core的系列應(yīng)用程序,例如Ardia Data Viewer、Ardia Instruments等,提供了特定功能。
無論是Chromeleon還是Xcalibur采集的數(shù)據(jù)都可以存儲在Ardia服務(wù)器上。Ardia Data Viewer提供了直接訪問服務(wù)器上數(shù)據(jù)的功能。用戶無需下載軟件,即可使用Web瀏覽器從進(jìn)行訪問,為任何擁有Ardia帳戶和查看數(shù)據(jù)權(quán)限的人提供提供了靈活性和便利性。
Ardia Instruments應(yīng)用程序界面中可顯示任何由 Xcalibur 或 Chromeleon 控制的儀器,包括采集狀態(tài)、當(dāng)前樣品進(jìn)度、進(jìn)樣列表中的剩余樣品以及預(yù)期的批次完成時間等信息。它還提供了一個可選的連接到服務(wù)中心的功能,使科學(xué)家們可以直接從軟件中提出服務(wù)請求。通過內(nèi)置的調(diào)度器,允許提前預(yù)約儀器的使用時間。
Ardia Data Insights提供了儀器的實(shí)時監(jiān)控和管理,使得科學(xué)家們可以有效地獲取整個實(shí)驗(yàn)室的儀器狀態(tài),充分利用實(shí)驗(yàn)室資產(chǎn),優(yōu)化實(shí)驗(yàn)室運(yùn)營。
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結(jié)語
Thermo Scientific Ardia平臺通過集成多種數(shù)據(jù)處理軟件和工作流程,提高實(shí)驗(yàn)室生產(chǎn)力,支持全球協(xié)作,安全管理數(shù)據(jù)和儀器。它代表了科學(xué)數(shù)據(jù)管理和分析的新標(biāo)準(zhǔn),旨在解鎖數(shù)據(jù)的力量,最大化資產(chǎn)利用,自動化工作流程,并利用歷史數(shù)據(jù)加速科學(xué)進(jìn)展。
想象一下,這種連接性對您的實(shí)驗(yàn)室將會產(chǎn)生多么深遠(yuǎn)的影響——Ardia平臺將幫助您更有效地使用儀器,輕松協(xié)作,快速獲取結(jié)果并簡化數(shù)據(jù)管理。
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