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（1）大型發(fā)酵罐的清洗以冷清洗為宜。因?yàn)闊崆榍逑磳?duì)設(shè)備本身不利。容器設(shè)計(jì)時(shí)沒(méi)有考慮忽冷忽熱時(shí)引起的溫差應(yīng)力，從而縮短容器的使用壽命。建議清洗溫度不超過(guò)40℃。
（2）清洗液回流泵的流量應(yīng)當(dāng)比清洗泵高約25%，這樣可避免大量液體在錐形罐停留。否則，罐就會(huì)被“淹沒(méi)”。如果洗罐的同時(shí)清洗管路，就要把清洗管路的清洗液用量也考慮進(jìn)去。
（3）含氯的清洗劑和滅菌劑都能對(duì)不銹鋼產(chǎn)生侵蝕，使用不銹鋼材質(zhì)的發(fā)酵罐時(shí)，要特別注意。常用的奧氏體不銹鋼如304，對(duì)氯離子濃度的安全使用界限為≤25μL/L，所以選擇清洗劑或殺菌劑，一定要考慮氯離子的濃度。
（4）目前，絕大多數(shù)的CIP系統(tǒng)沒(méi)有連接發(fā)酵罐的取樣閥（管），無(wú)法對(duì)取樣管路進(jìn)行有效的清洗，這樣對(duì)樣品的真實(shí)性有很大影響，尤其對(duì)微生物的檢驗(yàn)和控制影響更大。因此，必須打開(kāi)取樣閥，使清洗液也能流過(guò)取樣閥，使之得到清洗。
（5）安裝固定式洗球時(shí)，必須能夠使之刷洗到洗球上部的區(qū)域，在洗球的低部位應(yīng)當(dāng)留一個(gè)小孔，使洗滌器內(nèi)不留殘液。采用旋轉(zhuǎn)噴射型洗滌器時(shí)應(yīng)能自動(dòng)監(jiān)視自轉(zhuǎn)情況。
（6）經(jīng)常檢查清洗劑、滅菌劑的溫度和濃度等參數(shù)是非常重要的。如果在高溫下清洗大的發(fā)酵罐，必須考慮當(dāng)大罐罐身還很冷時(shí)，則會(huì)抵消清洗液的熱量，使洗滌無(wú)法保持預(yù)定的溫度。因此，在循環(huán)清洗時(shí)，應(yīng)在回路進(jìn)行溫度測(cè)量，以確定所清洗部位是否都達(dá)到了同樣的溫度。由于清洗過(guò)程中酸和堿會(huì)被稀釋?zhuān)瓒ㄆ跈z測(cè)和調(diào)節(jié)其濃度。
（7）由于大罐的清洗和滅菌耗費(fèi)很大，有必要將這筆費(fèi)用降到低限度。因此，大罐清洗時(shí)能夠簡(jiǎn)化清洗程序，如選用具有清洗和滅菌雙重作用的洗滌滅菌劑，使清洗和滅菌兩個(gè)過(guò)程一次完成。也可以使用免沖洗滅菌劑，節(jié)省制備無(wú)菌水的費(fèi)用和后一次沖洗的時(shí)間。
（8）對(duì)于清洗過(guò)的發(fā)酵罐，要進(jìn)行*的微生物檢查，以防止感染雜菌。當(dāng)發(fā)現(xiàn)微生物超標(biāo)時(shí)，必須通過(guò)廣泛深入的清洗和滅菌來(lái)確保發(fā)酵的安全性。